空岛篇结束后,草帽海贼团乘章鱼热气球从空岛飘下,但是章鱼热气球却逐渐缩小,以至于最后不能承载黄金梅丽号,致使梅丽号从天而降,直接落在了G8海军支部的环形要塞内部。
为了躲避海军的抓捕,所有人员都从黄金梅丽号上逃出而藏在G8支部的某个地方准备伺机再次重聚逃脱。而与此同时黄金梅丽号也落在了海军的手里,并且把草帽海贼团从空岛得到的宝藏查封。经过了激烈的战斗,草帽海贼团终于重聚,期间路飞和山治客串了一把海军厨师,乔巴和娜美客串了一把海军医生和护士,乌索普客串了一把修船工,而罗宾把从海军本部到来的巡查官打晕之后客串成了巡查官。而乌索普和索隆还被抓了一次,被路飞等人救了出来。当草帽海贼团趁乱即将逃出G8支部唯一的大门时,得知宝藏被海军查封消息的娜美命令路飞等人回航继续潜伏在了G8支部,目的是伺机夺回宝藏再出海。
路飞等人先去了储物仓库,本来G8司令官早转移了宝藏并且在仓库设下了天罗地网已经困住了路飞等人,却被从海军总部到来的白痴巡查官捣乱致使路飞等人趁乱逃跑。最后路飞等人终于在司令官的办公室找到了宝藏并且顺利带回了黄金梅丽号,正当一伙人乘着黄金梅丽号向着唯一的大门逃跑的时候,却由于不熟悉G8支部的潮汐状况而使船搁浅了,当然这都在G8司令官的计划之下。
最终为了逃跑,路飞从自己的裤裆里拿出了已经变小的章鱼,让它胀大成为热气球,再在乌索普从空岛带回来的冲击贝的配合下,使黄金梅丽号飞出了G8支部的环形要塞,再次起航。
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原来以为已经成功夺回黄金的路飞等人,却在要逃出那巴隆要塞时遭遇到空前的危机,由于这个要塞天然的屏障与地形,在退潮时任何船只都无法通过,让黄金梅丽号也被困在浅滩上无法动弹
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再次回到海军要塞的路飞等人,在乌索普的安排下兵分两组行动,首先是路飞,乌索普,索隆及罗宾为夺回黄金小队,而娜美和山治则是回收威霸小队,结果又只剩下乔巴一个看守黄金梅丽号。
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路飞他们好不容易到达了冲出外海的海门,却因为他们在空岛拿的黄金全部都不见了,让娜美坚持要回海军要塞抢回黄金,因为现在他们最重要的就是要花一大笔钱修理黄金梅丽号
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路飞果然在停靠黄金梅丽号的船坞遭遇到强敌,幸好柯芭特医生帮乔巴他们想出了妙计,由她和娜美假装成人质,逼迫德雷克少校让他们上船并且离开,不过最后海军识破了娜美也是海贼团成员之一
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路飞与山治救出了索隆和乌索普之后,立刻要赶往黄金梅丽号停泊的第88号船坞,而海军方面在强纳森司令官的安排下,先由德雷克到第88号船坞埋伏,并且派出第55特种部队来对付路飞他们争取时间
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与路飞他们分散后,乌索普原本和罗宾一起行动,后来因为乌索普心急地想先找到黄金梅丽号受不了罗宾一直在调查那巴隆要塞的事,一个人跑到整备队的船坞,却因此被德雷克少校抓到
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各自分散的路飞等人,娜美将自己乔装成打扫人员,路飞和山治则是假装成厨师混在大食堂中,只有独自一人的索隆被抓住了,另一个落单的乔巴也在千钧一发之际被送到了医务室,就这样阴错阳差之下乔巴为受伤的海军动手术
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路飞一行人分散之后,各自在这个叫做那巴隆的要塞中寻找出路,没想到山治与路飞误打误撞被当成新人的大厨师叫进了海军厨房,并且紧接着与海军厨师展开了一场战斗,不过以山治的技术当然是让人叹为观止
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在柯妮丝的帮忙下,路飞他们总算是平安降落了但是降落的地点却很不妙,因为竟然是他们海贼团的死对头海军要塞,不过路飞等船上的船员却都没有在船上,让这个要塞的司令官以及其它官兵都觉得匪疑所思