一行人捡到一个祭祀海神的酒桶,打开后里面竟冲出诡异的红色闪光,接着万里阳光号因暴风雨而航行到魔幻三角地带,在那里遇见吃了“黄泉果实”的神秘骷髅人布鲁克,路飞立刻邀请布鲁克成为伙伴,两人非常合得来,路飞还同意帮他夺回影子。就在他们和布鲁克对话时,船渐渐驶向世界最大海贼船“恐怖三桅帆船”。从以前就想要个音乐家的路飞邀请布鲁克成为同伴,但由于失去“影子”的布鲁克不能照射到阳光,因此拒绝了路飞的入团邀请,并一个人跑到岛上。草帽一行人陆续登陆恐怖三桅帆船,随后得知居住在“恐怖三桅帆船”里的是王下七武海月光·莫利亚。
在幽灵岛,路飞的影子被月光·莫利亚夺走并放入魔人奥兹体内,之后路飞与岛上被夺走影子的人群相遇,大家将众多影子装在路飞体内创造了梦魇路飞。梦魇路飞将奥兹重创后,路飞变回普通形态与草帽海贼团的大伙一同打败了奥兹和莫利亚。布鲁克为了完成和拉布的约定,以音乐家身份加入“草帽海贼团”。
大战后路飞筋疲力尽陷入昏迷,巴索罗米·熊打算取下路飞首级,最终因为索隆挺身而出放过路飞。知道事情的人为了不让路飞愧疚而都对路飞保密。路飞为了庆祝布鲁克入团而开宴会,但是因为当时索隆不在,又开了一场。在离开幽灵岛前,四皇夏洛特·玲玲的女儿罗拉将生命卡交给了草帽一伙。
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为了要将布鲁克留在万里阳光号上,成为伙伴,这下大家要夺回的影子又多了一个了。于是,有人是想要直接打倒月光·莫利亚,将影子和粮食一口气全部夺回来。有人则是燃烧着熊熊怒火,想要阻止婚礼的举行,将娜美找回来
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乌索普、乔巴与娜美躲在库玛西的身体里,一起进入了900号的所在处,并在这冰库里眼睁睁的,看着路飞的影子被送进魔人奥兹的尸体里。然后,就在魔人奥兹苏醒的那瞬间,三人因为惊吓过度发出声音被恶人们所发现。
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弗兰奇与罗宾因为布鲁克的说明,得知了要净化僵尸必须利用拥有大海力量的盐,将它塞到他们的嘴里,让僵尸的肉体和伪造的灵魂无法结合,就可以打倒先前他们怎么打都打不死的僵尸们。
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布鲁克将蜘蛛猴净化之后,他开始对弗兰奇与罗宾说起在五年前,他进入恐怖三桅帆船的经过,同时并说明将自己影子夺走的始作俑者,王下七武海月光·莫利亚,如何利用影子果实的能力,使影子透过尸体复活起来的过程。
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原本被罗拉的嫉妒之心追杀的娜美,因为在情急之下向罗拉随意扯谎她其实是个男人,并表示自己会支持她和阿布萨罗姆之后,三人于是利用罗拉绊住阿布萨罗姆的机会,趁那空档逃走。
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路飞他们在寻找娜美的途中,山治及索隆却相继的失去踪影,虽然剩下来的一行人觉得事情很不单纯,但是为了找回娜美,还要打飞月光·莫利亚,他们也只能往前进。只是没想到竟然遇到了一群不死之身的僵尸将军
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娜美他们好不容易逃过画像僵尸的追捕,躲进了一个房间里,这里的墙上挂满了很像是辛德莉的女孩的照片,可是看到一旁的报导又好像不是同一个人,接下来他们误打误撞来到霍古巴克医生的研究所,看到了惊人的事实
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除了娜美他们之外,路飞和其他人也上了这座岛,不过虽然遭遇到同样的怪生物,路飞他们的态度却完全不同,不但不害怕还主动出击,娜美他们则是在霍古巴克宅邸里,感受到处都是僵尸的可怕气氛
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乌索普,乔巴和娜美三人被希尔顿载往霍古巴克医生宅邸,不料他们在半途中看到外面可怕的景象要希尔顿送他们回原来的地方,希尔顿下车后却一去不回连马都不见了,被丢在墓园中的娜美他们只好下车结果就遭遇到一堆僵尸
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就在布鲁克上了万里阳光号没多久,一行人很快的就遇到了传说中在海上徘徊的鬼魂岛“恐怖三桅帆船”。透过布鲁克得知,原来之前所捡到的木桶果然是个陷阱,而布鲁克随后就朝着岛的方向离开消失无踪。
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魔鬼三角地带真的出现了幽灵船!?由于一行人在幽灵船上看到了正在唱着船歌的骷髅,路飞于是决定要上船去一探究竟。就在看到骷髅人的瞬间,路飞就决定要他加入草帽海贼团甚至还将他带到万里阳光号上。
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路飞他们在海上捡到了一个标示有文字“海神御宝前”的木桶,一行人于是欢喜鼓舞的打开木桶,但是桶里冒出来的却是一道红色的光。就在知道这是发光弹的同时,娜美查觉海上来了股奇怪的气压