在离开阿拉巴斯坦城市猷巴,前往说服叛乱军的路上,路飞认为就算说服了叛乱军也无法阻止克洛克达尔而与不想任何人牺牲的薇薇发生了冲突。薇薇说这个国家的人民并没有做错任何事情,为什么要死,全都是克洛克达尔的错,她不希望国王军的士兵死,也不希望叛乱军的人民死,更不希望一直陪伴她的。
草帽一行人死,但她自己却拼了命的阻止内战。她明白,若是去找克洛克达尔的话,绝对会给草帽海贼团带来更大的麻烦,她不想让路飞他们冒险。放声大哭,决定去找克洛克达尔。
后来在薇薇公主和草帽海贼团的努力下,克洛克达尔被打败,国家下的第一场雨同时也平息了战火。
海贼王阿拉巴斯坦篇从第61集~第130集。
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路飞一行人好不容易走到了雨地,不料在那里等着他们的却是斯摩格上校及达斯琪带领的海军。一场混乱的追逐之后,路飞一行人冲进了克洛克达尔所在的赌场“雨宴”
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路飞一行人终于来到犹巴,但是往昔繁荣的犹巴绿洲却被沙暴袭击,俨然成为一个没有水的废墟薇薇在城里与多托叔叔多年相逢,老人透露了犹巴的兴衰,以及以寇沙为首的叛乱军早已经在卡特莱亚绿洲集结
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与艾斯分手之后,路飞一行人继续往犹巴赶路希望能在叛乱军出击之前,制止这场由克洛克达尔暗中煽动的内乱,然而沙漠中炎热难耐路飞又开始热到发疯害索隆和乔巴一起走失了
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路飞一行人在岩场休息,娜美和薇薇很惊讶路飞和艾斯虽为兄弟却有不同的风格,此时蝎子男出现要取艾斯项上人头,艾斯听说蝎子男曾经打败过他正在追捕的黑胡子,本来去犹巴就是为了要向他讨教
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往犹巴的路上娜美好奇的问薇薇关于叛乱军的事,原来叛乱军的首领寇沙。其实与薇薇公主从小就是好朋友,热血少年寇沙为了村民幸福与国王争执薇薇也与他大打出手,后来两人一起率领村里的沙沙团
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路飞一行人告别了砂贼之后,前往水井村补给食物和水,而水井村其实有卡谬小混混等人冒充叛军名义骗吃骗喝。薇薇不愿意见到叛乱军名号被拿来欺骗村民
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路飞一行人赶往犹巴的路上,却因为娜美和薇薇坐上睫毛骆驼而走失。后来发现原来娜美她们被砂贼巴鲁巴鲁团抓去了,不过不打不相识原来巴鲁巴鲁团的拉沙与薇薇公主小时候相识
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路飞一行人继续在沙漠行走热到头晕,路飞一时大意被大骗鸟砂漠盗贼骗走了所有行李。路飞生气追出去后却惹来一只沙漠大蜥蜴。于是山治、路飞、索隆联手打败蜥蜴而且意外救了一只骆驼
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路飞一行人终于来到沙漠入口,却遇到了功夫海牛的挑战。路飞居然战胜了功夫海牛,还依规矩收他们为徒。幸好乔巴机智解危,于是一行人继续往犹巴出发并且经过了一个废城爱尔马尔,这里曾经是人称的绿之城
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艾斯为了让路飞逃跑,以火拳与使用冒烟果实能力的斯摩格上校对抗,艾斯到了路飞船上与路飞的同伴见面了并且婉拒了他们的入团邀约,因为他正在追补一个叫黑胡子的人
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挥别希鲁鲁克的夜樱,以及Dr.库蕾哈的多年照顾乔巴接下来面对的是海贼的冒险生涯。而首先这一船的传奇人物即将要面对的,不仅仅是返回阿拉巴斯坦外,还要面临由克洛克达尔率领的一群具有邪恶企图的高级特务。
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路飞盛情邀约乔巴加入他们的海贼行列,乔巴虽然深爱遇到希鲁鲁克医生和朵丽儿医娘的磁鼓岛,但是它的梦想不仅仅是找到同伴,还想去看看医生说的海贼刺激生活
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瓦尔波溜进了城堡里跟娜美撞个正着,正准备要吃掉她时幸好被路飞追到。瓦尔波不甘心上楼要用皇家大铁炮把路飞炸掉,没想到却被雪鸟筑巢在炮内无法发炮
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路飞决心不让瓦尔波将海贼旗折断,他踏上城堡顶端捍卫旗子的勇气更激发了乔巴的斗志。于是乔巴吞下自己研发的蓝波球,不仅让动物三段变形演变成七段变形,还把杰斯马利蒙打的落花流水,瓦尔波却趁隙溜进城堡里面。
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路飞他们好不容易被Dr.库蕾哈收留医治,瓦尔波却又追来了。原来瓦尔波与库蕾哈,乔巴都有难解的仇恨纠葛。于是,这群原本不相干的人结合起来与瓦尔波和他的爪牙打斗
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希鲁鲁克与乔巴的故事,在希鲁鲁克患了重病之后眼看着就要画下句点。不过乔巴还是不死心不顾自己的性命找回自以为是万能药的阿蜜乌菇,乔巴根本不知道这其实是剧毒菇
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路飞发现了乔巴的秘密,觉得他很厉害也很有趣,非要乔巴加入他们不可。就在这时候,库蕾哈医生对娜美及山治说出了乔巴悲惨的身世
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路飞好不容易背着娜美,拖着受伤的山治从死里逃生准备爬上山顶,却又遇到了瓦尔波等人来找麻烦。幸好曾经受过路飞恩情的拉邦出来解救危机。
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由于瓦尔波的归来,让磁鼓岛的百姓又陷入恐慌,不过前守备队队长多尔顿,却挺身而出要为大家而战。可是他一个人终究寡不敌众遭到乱枪射击
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就在路飞跟山治冒险带着娜美冒险去山上时,没想到Dr.库蕾哈已经下山了,还帮一个小男孩治病。薇薇与乌索普跟着多尔顿先生急着赶去找医生,不料Dr.库蕾哈又走了。偏偏就在这时候瓦尔波跟他的军团回到了磁鼓岛。